Después de sus estudios universitarios de biología, zoología y psicología en la Universidad de Colonia,2 cursó diversas formaciones técnico-policiales profesionales en medicina legal en los EE.UU., entre otras instituciones, en la Academia del FBI.3 4
Benecke es llamado como perito para evaluar los restos biológicos en supuestos casos de violencia con consecuencias fatales. Así, en 1997/98, después de analizar gusanos, determinó el tiempo que pasó tirado el cadáver de la esposa asesinada del pastor Klaus Geyer. Dado que Geyer no tenía una coartada para el momento en cuestión, fue condenado por el homicidio de su cónyuge.
En el caso del asesinato de una mujer incapacitada en Colonia, Benecke determinó, basándose en las moscas muertas encontradas, que ésta había sido desatendida por su enfermera. En colaboración con el FSB ruso, Benecke analizó los supuestos cráneos y dentadura de Adolf Hitler.